STAR TREK: ENTERPRISE si svolge negli anni delle prime esplorazioni dello spazio, agli albori dei viaggi stellari. Con le mappe stellari quasi vuote, l'equipaggio dell'ENTERPRISE deve dimostrare di essere pronto a vivere fra le stelle.
Archer e l'NX-01 si ritrovano nel passato della Terra, con gli eventi della seconda guerra mondiale alterati dalla guerra fredda temporale.